Информация о материале

Статьи

18 апреля 2018

Просмотров: 6455

Сроки приема документов на обучение по программам аспирантуры в 2025 году

для граждан Российской Федерации, иностранных граждан и лиц без гражданства

Прием осуществляется на очную форму обучения по программам подготовки научных научно-педагогических кадров в аспирантуре в рамках контрольных цифр приема (КЦП), утвержденных Минобрнауки России за счет бюджетных ассигнований РФ (включая целевую квоту):

• 1 этап (основной):
  20 июня – 2 июля 2025 года;
  
•  2 этап (дополнительный, при наличии свободных мест):
  8 – 15 сентября 2025 года.

Подать документы в приемную комиссию поступающий может:
• Лично поступающим в отдел аспирантуры ИИФ УрО РАН на бумажных носителях,
• Через операторов почтовой связи общего пользования в отдел аспирантуры ИИФ УрО РАН на бумажных носителях

Контактные данные: 620078, г. Екатеринбург, ул. Первомайская, д.106, ком. 138,В зав. отделом аспирантуры Арташян О.С.В Телефон: (343) 374-08-39, доб.129; (343) 374-00-70;

• Посредством федеральной государственной информационной системы «Единый портал государственных и муниципальных услуг (функций)» (ЕПГУ)*

*При подаче заявления о приеме посредством ЕПГУ документы, необходимые для поступления, представляются поступающим в виде электронных образов или представляются в виде оригиналов или копий, за исключением документов, удостоверяющих личность, гражданство, документов, подтверждающих регистрацию в системе индивидуального (персонифицированного) учета, документов об образовании. Подробная информация – в Правилах приема в 2025/26 уч.г.

Для поступления на обучение поступающие подают заявление о приеме в аспирантуру на имя директора ИИФ УрО РАН (скачать образец) с приложением следующих документов:

• Протокол устного собеседования с предполагаемым научным руководителем о согласии на научное руководство работой аспиранта по подготовке диссертации, на время обучения в аспирантуре, скрепленным собственноручной подписью предполагаемого научного руководителя и датой проведения собеседования (скачать образец);
• копия документа (документов), удостоверяющего личность и гражданство поступающего (паспорт);
• копия страхового свидетельства обязательного пенсионного страхования (СНИЛС);
• Оригинал и копия диплома государственного образца уровня специалиста или магистра, приложение к диплому (не позднее 11.07.2025 по основному приему);
• при необходимости создания специальных условий при проведении вступительных испытаний - документ, подтверждающий инвалидность;
• автобиография с анкетными данными (скачать образец);
• четыре фотографии поступающего, размер 3*4 см;
• документы, свидетельствующие об индивидуальных достижениях, при желании поступающего лица*;
• Заявление о согласии на зачисление (не позднее 11.07.2025 по основному приему);
• Заявление о согласии на обработку персональных данных.

* Документы, подтверждающие индивидуальные достижения поступающего:

• • список опубликованных научных работ по тематике, соответствующей укрупненной группе направлений подготовки в аспирантуре. Вместе со списком предоставляется: в случае журнальной публикации — копия публикации, в случае публикации в сборнике научных трудов — копия страницы с выходными данными сборника, копия содержания сборника и копия самой публикации;
  • реферат (не менее 20 страниц) с визой потенциального научного руководителя, свидетельствующий о наличии задела по диссертационной работе;
  • иные документы и материалы, подтверждающие участие поступающего в научных мероприятиях (конференции, семинары, научные школы) с докладами по тематике, соответствующей укрупненной группе направлений подготовки в аспирантуре;
  • документы и материалы, подтверждающие участие поступающего в научно-исследовательских проектах, в студенческих исследовательских проектах, грантах в качестве исполнителя или руководителя;
  • свидетельства на изобретения, патенты, компьютерные программы (результаты интеллектуальной деятельности — РИД);
  • копии приказов о назначении поступающему стипендий Президента РФ или Правительства РФ;
  • протоколы сдачи кандидатских экзаменов по специальной дисциплине, философии и иностранному языку (при наличии);
  • иные документы (по усмотрению поступающего лица).

Проведение вступительных испытаний

Информация о материале

Статьи

18 апреля 2018

Просмотров: 13509

Отдел аспирантуры ИИФ УрО РАН осуществляет подготовку аспирантов по программам подготовки научных и научно-педагогических кадров в аспирантуре, соответствующих научным специальностям, по которым присуждаются ученые степени (приказ Минобрнауки РФ от 24.08.2021 г.№786) :

Область науки - 1. Естественные науки

Группа научных специальностей - 1.5 Биологические науки

Научные специальности –

• • • 1.5.2 Биофизика
      
    • 1.5.5.Физиология человека и животных

Область науки - 3. Медицинские науки

Группа научных специальностей - 3.2 Профилактическая медицина

Научная специальность – 3.2.7 Иммунология

Группа научных специальностей - 3.3 Медико-биологические науки

Научная специальность – 3.3.3 Патологическая физиология

Квалификация выпускника: Исследователь. Преподаватель-исследователь.

Форма обучения: очная.

Сроки обучения:

1.5.2 Биофизика – 4 года,

1.5.5.Физиология человека и животных – 4 года,

3.3.3 Патологическая физиология – 4 года,

3.2.7 Иммунология – 3 года.

Лицензия на осуществление образовательной деятельности № Л035-00115-66/00096348 от 29 мая 2012 г.
Выписка из реестра лицензий по состоянию на 13:46 «30» августа 2023 г. 

Свидетельство о государственной аккредитации №1755 от 18 марта 2016 г. (серия 90А01 № 0001848). Приложение №1 к свидетельству о государственной аккредитации по направлению подготовки 30.00.00 Фундаментальная медицина, подготовка кадров высшей квалификации (серия 90А01 № 0010313). Приложение №2 к свидетельству о государственной аккредитации по направлению подготовки 06.00.00 Биологические науки, подготовка кадров высшей квалификации (серия 90А01 № 0015160).

План мероприятий в аспирантуре ИИФ УрО РАН в течение 2024/25 учебного года

Email: Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.

Зав. отделом аспирантуры: к.б.н. Арташян Ольга Сергеевна

Информация о материале

Статьи

18 апреля 2018

Просмотров: 1594

Скачать приложение к приказу

Информация о материале

Статьи

18 апреля 2018

Просмотров: 852

Объявляется конкурсный набор в аспирантуру Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института иммунологии и физиологии Уральского отделения Российской академии наук (ИИФ УрО РАН) на 2025/2026 учебный год.

Список зачисленных лиц в аспирантуру ИИФ УрО РАН в 2025 г.

Основание: протокол комиссии по приему в аспирантуру ИИФ УрО РАН от «09» июля 2025 г №2

Список поступающих лиц в 2025 году в аспирантуру ИИФ УрО РАН, допущенных к прохождению ВИ:

Основание: протокол комиссии по приему в аспирантуру ИИФ УрО РАН от «02» июля 2025 г №1

Прием для обучения по программам подготовки научных и научно-педагогических кадров в аспирантуре – очная форма обучения осуществляется по следующим группам научных специальностей:

Основной этап

Прием документов для поступления в аспирантуру ИИФ УрО РАН проводится:

с 20 июня по 2 июля 2025 г. (целевой прием, общий конкурс, по договору об оказании платных образовательных услуг);

Прием вступительных испытаний (в соответствии с расписанием): с 3 июля по 10 июля 2025 г.

Размещение  ранжированных  списков  поступающих  не  позднее 11 июля 2025 г.

Завершение приема оригинала документа установленного образца, заявления о согласии на зачисление, оформления договоров об оказании платных образовательных услуг: не позднее  15 июля 2025 г.

Дополнительный этап (при наличии вакантных мест)

Прием документов для поступления в аспирантуру ИИФ УрО РАН  проводится:

с 8 по 15 сентября 2025 г. (общий конкурс, по договору об оказании платных образовательных услуг);

Прием вступительных испытаний в дополнительный этап  (в соответствии с расписанием): с 16 по 26 сентября 2025 г.

Размещение  ранжированных  списков  поступающих  не  позднее 1 октября 2025 г.

Завершение приема оригинала документа установленного образца, заявления о согласии на зачисление, оформления договоров об оказании платных образовательных услуг: не позднее  1 октября 2025 г.

Издание приказа о зачислении в аспирантуру по результатам вступительных экзаменов не позднее 31 октября 2025 г.

К освоению программ подготовки научных и научно-педагогических кадров в аспирантуре допускаются лица, имеющие образование не ниже высшего образования (специалитет или магистратура).

Подача документов осуществляется лично по предварительной записи, через операторов почтовой связи общего пользования, через Суперсервис «Поступление в вуз онлайн» на портале Госуслуг.

Перечень необходимых документов находится на официальном сайте Института (перейти) в разделе «Аспирантура» - «Прием в аспирантуру» - «Сроки и место приема документов».

Программы вступительных испытаний находятся на официальном сайте Института (перейти) в разделе «Аспирантура» - «Прием в аспирантуру» - «Вступительные испытания».

Поступающие в аспирантуру сдают очно следующие вступительные испытания:

Приоритетность вступительных испытаний при ранжировании списков поступающих (внутри отдельного конкурса):

1. На обучение в аспирантуру зачисляются лица, имеющие более высокое количество набранных баллов по всем вступительным испытаниям;
2. При равенстве суммы баллов, начисленных по результатам всех вступительных испытаний, зачисляются лица, имеющие более высокое количество баллов, начисленных по результатам вступительного испытания по специальной дисциплине;
3. При равенстве суммы баллов, начисленных по результатам всех вступительных испытаний, и имеющих равные баллы по специальной дисциплине, зачисляются лица, имеющие более высокое количество баллов, начисленных за индивидуальные достижения.

Лицам, поступающим в аспирантуру Института, общежитие не предоставляется.

Отдел аспирантуры ИИФ УрО РАН
620078, г. Екатеринбург, ул. Первомайская, 106, 1 этаж, к. 138,
тел. 8(343) 374-00-70
Зав. аспирантурой Арташян Ольга Сергеевна

Правила приема в аспирантуру в 2025 году

Cкачать правила приема в формате PDF

Особенности приема в аспирантуру в соответствии с ФЗ № 19-ФЗ от 17.02.2023 г.

Скачать в формате PDF

Информация о материале

Статьи

11 апреля 2018

Просмотров: 3085

Уважаемые коллеги!

На сайте института размещен Временный порядок выплаты рейтинговых стимулирующих надбавках сотрудникам ИИФ УрО РАН за публикационную активность в изданиях, индексируемых в базах SCOPUS и Web of Science до 31 марта 2018 г. (скачать pdf).

Также на сайте досупен список публикаций, учтенных при расчете стимулирующих надбавок за I квартал 2018 г. (скачать xls).

Внимание!

Заявления о неучтенных публикациях за 2017 год, коррекции имеющиейся информации и другие уточнения направлять отвественному по наукометрическим показателям Смолюку Л.Т. (с.н.с. лаборатории биологической подвижности) до 28 февраля 2018 г.

Информация о материале

Статьи

22 февраля 2018

Просмотров: 153568

Создание условий для обучения лиц с ограниченными возможностями здоровья в аспирантуре ИИФ УрО РАН

В ИИФ УрО РАН возможно обучение по следующим научным специальностям:

• Биофизика 1.5.2
• Физиология человека и животных 1.5.5
• Иммунология 3.2.7
• Патологическая физиология 3.3.3

Организация учебного процесса:

1. В ИИФ УрО РАН возможны следующие формы реализации образовательных программ для лиц с ОВЗ:
   1. Дистанционное обучение;
   2. Индивидуальное обучение;
   3. Он-лайн курсы, реализуемые с применением электронного обучения.
2. Возможно составление индивидуальных учебных планов аспирантов и индивидуального графика обучения с учетом особенностей здоровья.

Информационное обеспечение:

1. Адаптация сайта ИИФ УрО РАН для слабовидящих инвалидов;
2. Обеспечение доступности библиотечного фонда.

Обеспечение физической доступности инфраструктуры ИИФ УрО РАН:

1. Создан доступ инвалидов в помещения Института. Доступ осуществляется без использования вспомогательного оборудования: на крыльце здания на высоте 0,9 метра от уровня земли установлена кнопка вызова сотрудника учреждения, для последующего сопровождения через запасной вход в здание, у которого убраны ступени для беспрепятственного проезда по ним.
2. Есть возможность оборудования парковочного места для автомобилей инвалидов. 

По всем вопросам обучения обращаться к зав. отделом аспирантуры Тел. (343) 374-00-70

Информация о материале

Статьи

09 января 2018

Просмотров: 7646

1. Рекомендация ВАК от 26.10.2022 №2-пл/1 "О новых критериях к соискателям ученых степеней кандидата наук, доктора наук, к членам диссертационных советов"
2. Рекомендация ВАК от 24.06.2021 №1-пл/6 "О научных публикациях ученых, написанных в соавторстве, в связи с присуждением им ученых степеней, а также назначении по одной диссертации одновременно двух научных консультантов или научного руководителя и научного консультанта"
3. Рекомендация ВАК от 24.06.2021 №1-пл/5 "Об использовании электронных систем для подтверждения оригинальности диссертационных исследований"
4. Рекомендация ВАК от 21.12.2023 №3-пл/1 "О категорировании перечня рецензируемых научных изданий, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук"
5. Итоговое распределение журналов Перечня ВАК по категориям К1, К2, К3 на декабрь 2023 года
6. Таблица - Приравнивание научных журналов, входящих в наукометрические базы данных, к журналам Перечня ВАК с распределением по категориямТаблица - Приравнивание научных журналов, входящих в наукометрические базы данных, к журналам Перечня ВАК с распределением по категориям
7. Письмо МинОбрНауки от 04.07.2023 №МН-3/6325 "О кандидатских экзаменах"
8. Письмо МинОбрНауки от 04.07.2023 №МН-3/6325 "О подтверждении результатов кандидатских экзаменов"
9. Паспорт научной специальности 3.2.7. «Аллергология и иммунология»
10. Паспорт научной специальности 3.3.3. «Патологическая физиология»
11. ПРАВИЛА ОФОРМЛЕНИЯ ДИССЕРТАЦИИ (Диссертация и автореферат диссертации оформляются в соответствии с ГОСТ Р 7.0.11-2011)
12. Список документов для представления в диссертационный совет и апробации

Информация о материале

Статьи

30 октября 2017

Просмотров: 6228

В данном разделе размещена информация для аспирантов, обучающихся по направлению "Физиология".

Вы можете скачать следующие документы:

• Расписание занятий в аспирантуре на первый семестр 2022 г (1 курс);
• Основная образовательная программа;
• РАБОЧАЯ ПРОГРАММА ДИСЦИПЛИНЫ "ФИЗИОЛОГИЯ"
• РАБОЧАЯ ПРОГРАММА ДИСЦИПЛИНЫ «ФИЗИОЛОГИЯ СИСТЕМЫ КРОВИ»;
• РАБОЧАЯ ПРОГРАММА ДИСЦИПЛИНЫ «СРАВНИТЕЛЬНАЯ ФИЗИОЛОГИЯ»;
• РАБОЧАЯ ПРОГРАММА ДИСЦИПЛИНЫ "ИММУНОФИЗИОЛОГИЯ";
• РАБОЧАЯ ПРОГРАММА ДИСЦИПЛИНЫ "МОЛЕКУЛЯРНАЯ ФИЗИОЛОГИЯ";
• РАБОЧАЯ ПРОГРАММА ДИСЦИПЛИНЫ "ФИЗИОЛОГИЯ РЕГЕНЕРАТОРНЫХ ПРОЦЕССОВ";
• РАБОЧАЯ ПРОГРАММА ДИСЦИПЛИНЫ "Физиология эндокринной системы";
• РАБОЧАЯ ПРОГРАММА "ПЕДАГОГИЧЕСКАЯ ПРАКТИКА";
• РАБОЧАЯ ПРОГРАММА "НАУЧНО-ОРГАНИЗАЦИОННАЯ ПРАКТИКА";
• Расписание промежуточной аттестации 1;
• Расписание промежуточной аттестации 2;
• Календарный учебный график для обучающихся очно.

Информация о материале

Статьи

04 октября 2017

Просмотров: 7698

Аспиранты, поступившие в 2025 году:

• Антонец Юлия Ярославовна
• Бельдия Евгения Александровна
• Демичева Екатерина Ивановна
• Жигулина Мария Вадимовна
• Лобенская Анастасия Юрьевна
• Среднева Любовь Александровна
• Стукалова Наталья Александровна

Аспиранты, поступившие в 2024 году:

• Верховская Мария Дмитриевна
• Вотинова Вероника Олеговна
• Задорина Дарья Николаевна
• Мосунов Андрей Алексеевич
• Оберюхтин Денис Андреевич
• Сарапульцев Герман Петрович
• Цыбина Алена Евгеньевна

Аспиранты, поступившие в 2023 году:

• Гусарова Евгения Олеговна
• Потоскуева Юлия Константиновна
• Туканов Данил Александрович

Аспиранты, поступившие в 2022 году:

• Александрова Анастасия Дмитриевна
• Ибрагимов Роман Владимирович
• Крицкий Игорь Сергеевич
• Зудова Алевтина Игоревна

Аспиранты, поступившие в 2021 году:

• Симонова Раиса Анатольевна
• Султанова Татьяна Рашидовна

Аспиранты, поступившие в 2020 году:

• Бутова Ксения Андреевна
• Власова Анастасия Алексеевна
• Кочурова Анастасия Михайловна
• Чумаков Никита Сергеевич

Аспиранты, поступившие в 2019 году:

• Волжанинов Денис Александрович
• Усачёв Владимир Александрович
• Федотиков Евгений Романович
• Черемохин Дмитрий Андреевич
• Хлыстова Карина Алексеевна

Аспиранты, поступившие в 2018 году:

• Забков Олег Игоревич
• Фомина Людмила Олеговна
• Файзуллина Анастасия Ирековна
• Берг Валентина Юрьевна

Аспиранты, поступившие в 2017 году:

• Лозновенко Наталия Сергеевна
• Хамзин Святослав Юрьевич
• Бочкарев Петр Юрьевич
• Афанасьев Евгений Витальевич

Аспиранты, поступившие в 2016 году:

• Герцен Оксана Павловна
• Долгих Мария Андреевна
• Овсепян Нарек Андраникович

Аспиранты, поступившие в 2015 году:

• Белоусова Анна Викторовна
• Поздина Варвара Александровна
• Докучаев Арсений Дмитриевич
• Щипачева Ольга Владимировна

Информация о материале

Статьи

20 сентября 2017

Просмотров: 5443

 

	Фамилия Имя Отчество	Должность, ученая степень и звание	ORCID, ключевые слова	Телефон рабочий	E-mail
	Бершицкий Сергей Юрьевич	зав. лаб., д.б.н. с.н.с.	Мышечное сокращение, актин-миозиновое взаимодействие, механика мышечного волокна, скачок температуры, рентгеновская дифракция, структура-функция, тропомиозин, кальциевая регуляция сокращения, одиночные взаимодейсвия, оптическая ловушка, in vitro подвижная система (motility assay)	+7(343) 3741316	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Балакин Александр Александрович	С.н.с., к.б.н.	Миокард, неоднородность, взаимодействие, адаптация, потенциал действия, длинозависимая регуляция, медленный ответ силы сокращения, реальное время	+7(343) 374-7524 доб. 119	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Бершицкий Борис Юрьевич	Инженер		+7(343) 374 1316	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Копылова Галина Васильевна	ст.н.с., к.б.н.	Сокращение поперечно-полосатых мышц, актин-миозиновое взаимодействие, кальциевая регуляция, изоформы сердечного и скелетного миозина, тропомиозин, in vitro подвижная система	+7(343) 374 1316	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Кочурова Анастасия Михайловна	м.н.с.
	Кузнецов Даниил Андреевич	н.с.	Миокард, неоднородность, сократимость, длинозависимая регуляция, медленный ответ силы сокращения, грузозависимое расслабление, изолированное сердце, петля давление-объём.	+7(343) 374 7524 доб. 132	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Лисин Руслан Владимирович	м.н.с.	Миокард, неоднородность, взаимодействие, адаптация, длинозависимая регуляция, медленный ответ силы сокращения, грузозависимое расслабление	+7(343) 374-7524 доб. 119	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Набиев Салават Рафаилович	н.с., к.б.н.	Актин, миозин, поперечно-полосатая мышца, оптическая ловушка, одиночные взаимодействия сократительных белков, искусственная подвижная система, механика скелетно-мышечного волокна	+7(343) 374 1316	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Никитина Лариса Валерьевна	В.н.с., д.б.н.	Актин-миозиновое взаимодействие, миокард, изоформы миозина, искусственная подвижная система, кардиотоксичность	+7(343) 374 1316	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Проценко Юрий Леонидович	Г.н.с., д.б.н.	Миокард, сократимость, длинозависимая регуляция, неоднородность, биомеханика, кардиомиоцит, кальций	+7(343) 374-7524 доб. 131	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.

Молекулярные механизмы мышечного сокращения и его регуляции

Механизмы регуляции сократимости и биомеханика миокарда

Важнейшие результаты

На основе данных механических экспериментов на одиночных волокнах скелетной мышцы и скачка температуры (Bershitsky, Tsaturyan, J. Physiol., 2002) с одновременной регистрацией на синхротронных источниках рентгеновского излучения (SRS, Daresbury, Великобритания; ESRF, Grenoble, Франция) изменений (Рис. 1) их молекулярной структуры (Bershitsky et al., Nature, 1997; Tsaturyan et al., Biophys. J., 1999; Bershitsky et al., Front. Biosci., 2009):

Рис. 1. (А) 3-кадровый протокол и (Б) разностные рентгеновские дифракционные паттерны  (Ferenczi et al., Structure, 2005).

• предложена модель двухшагового механизма генерации силы молекулой миозина;
• установлен механизм поддержания филаментарного порядка в расслабленной мышце (Bershitsky et al., Biophys. J., 2010);
• измерено удлинение актиновой спирали при присоединении молекул миозина (Tsaturyan et al., Biophys. J., 2005);
• получена оценка числа молекул миозина, участвующих в развитии силы при изометрическом сокращении скелетной мышцы, и силы, развиваемой одной молекулой миозина (Tsaturyan et al., Biophys J., 2011).

Рис. 2. Структурно-кинетическая модель силогенерирующего шага субфрагмента-1 миозина (Ferenczi et al., Structure, 2005).

В лаборатории поставлена методика in vitro подвижной системы (ИПС; Рис. 3) и реконструкции регулируемых тонких нитей, содержащих актин и регуляторные белки – тропонин и тропомиозин, которая позволяет визуализовать взаимодействие сократительных белков, регистрируя движение тонких нитей по миозину и влияние на это взаимодействие регуляторных белков, используя их различные комбинации.

Рис. 3. Блок-схема установки in vitro подвижной системы (слева), принцип устройства проточной ячейки (А) и фотография поля зрения с флуоресцентно-мечеными тонкими нитями (В).

С помощью этой методики:

• показано влияние сердечного миозин-связывающего белка С на взаимодействие миозина с актиновой нитью (Shchepkin et al., BBRC, 2010; Набиев с соавт., Биофизика, 2019);
• установлено, что скорость движения тонких нитей в искусственной подвижной системе и кальциевая чувствительность скорости зависят от изоформ как миозина, так и тропомиозина (Shchepkin et al., BBRC, 2017; Matyushenko et al., Biochimie, 2020);
• выяснено функциональное значение консервативных неканонических амино-кислотных остатков в центральной части молекулы тропомиозина (Shchepkin et al., Acta Naturae, 2013; Matyushenko et al., FEBS J., 2014);
• установлены молекулярные механизмы развития кардио- и миопатий, ассоциированных с мутациями тропомиозина (Matyushenko et al., Biochemistry, 2017; Matyushenko et al., Int. J. Biol. Macromol., 2018; Kopylova et al., J. Muscle Res. Cell Motil., 2019; Bershitsky et al., FASEB J., 2018; Matyushenko et al., FASEB J., 2020).

При исследовании этой методикой влияния посттрансляционных модификаций миозина и тропомиозина на актин-миозиновое взаимодействие обнаружено, что:

• карбонилирование миозина нарушает актин-миозиновое взаимодействие в сердечной (Kopylova et al., Eur. Biophys. J., 2018) и скелетных мышцах, уменьшая количество головок миозина в силогенерирующем состоянии (Kopylova et al., Biochemistry (Mosc), 2018; Кочубей с соавт., Бюлл. эксп. биол. мед., 2018);
• внутримолекулярная дисульфидная сшивка тропомиозина по Cys190 влияет на характеристики взаимодействия сократительных и регуляторных белков миокарда (Matyushenko et al., BBRC, 2017; Щепкин с соавт., Бюлл. эксп. биол. и мед., 2019);
• фосфорилирование тропомиозина оказывает эффект на сократительную функцию миокарда при патологиях, сопровождающихся ацидозом (Kopylova et al., J. Muscle Res.Cell Motil., 2021).

Сотрудниками лаборатории на базе инвертированного флуоресцентного микроскопа построена двухлучевая управляемая оптическая ловушка (Рис. 4), которая позволяет измерять механические и кинетические характеристики взаимодействия одиночных молекул миозина с филаментарным актином или с реконструированной тонкой нитью (Рис. 5): размер шага молекулы миозина, время его совершения, развиваемую им силу.

Рис. 4. Блок-схема и общий вид установки оптической ловушки.

Рис. 5. Пример экспериментальной записи одиночных актин-миозиновых взаимодействий в оптической ловушке в режиме перемещения (A,B) и квазиизометрической фиксации длины (C, D, E).

С помощью этого инструмента:

• выяснена зависимость кинетики распада актомиозинового комплекса от приложенной нагрузки (Nabiev et al., Biophys. J., 2015);
• изучено влияние канонических аминокислотных замен в центральной части молекулы тропомиозина на кинетические и механические характеристики взаимодействия одиночной молекулы миозина с регулируемой тонкой нитью (Shchepkin et al., J. Muscle Res.Cell Motil., 2017);
• разработана методика измерения изгибной жёсткости актиновой, либо тонкой, нити в оптической ловушке (Рис 6, 7) и показано, что одиночные амино-кислотные замены в центральной части молекулы тропомиозина измеримо влияют на изгибную жёсткость тонкой нити (Nabiev et al., Biophys. J., 2015).

Впервые проведена оценка количественных показателей пространственно-временной неоднородности кинетики стенки левого желудочка сердца и описаны динамические изменения индексов формы левого желудочка во время сердечного цикла в норме и при разных видах сердечно-сосудистой патологии, в частности при ишемической болезни сердца, дилатационной кардиомиопатии, при ортотопической трансплантации сердца, позволившие сформулировать представление о новой физиологической характеристике – функциональной геометрии сердца. Проведена оценка показателей функциональной геометрии сердца в онтогенезе.

Рис. 6. К двум шарикам радиуса R, удерживаемым в двух оптических ловушках, прикрепляется фрагмент тонкой нити (толстая линия) и формируется гантель, как показано во вставке; непрерывные линии показывают положения шариков и конфигурацию нити под действием растягивающей силы F.

Рис. 7. Диаграмма «удлинение-сила» гантели с реконструированной тонкой нитью A – Зависимость растягивающей силы F от безразмерного удлинения h/R, где h – изменение половины расстояния между шариками, R – радиус шарика. Показаны также микрофотографии первого и последнего шага растяжения в цикле, состоящем из 14 шагов растяжения по 50 нм каждый. Центры масс изображения шариков показаны вертикальными линиями. B – Одномерный профиль интенсивности изображений шариков, показанных на панели A.

Разработанным методом исследования стохастических процессов при модуляции сократимости миокарда на препаратах животных обнаружен положительный инотропный эффект дисперсии ритма (Izakov, Protsenko, Sov. Med. Rev. A. Cardiol., 1989).

Рис. 8. Последовательность изометрических сокращений (Pn-1, Pn, Pn+1…Pi) папиллярной мышцы кролика при стимуляции в режиме задания случайной величины длительности межимпульсного интервала Тn-1, Tn, Tn+1…Ti .

В рамках нового направления (биомеханика неоднородного миокарда) разработан уникальный метод экспериментального исследования механической и электрической активности модели неоднородного миокарда - метод мышечных дуплетов. Показано, что пространственно-временная морфо-функциональная неоднородность кардиомиоцитов в стенке желудочка определяет новый класс процессов внутренней оптимизации сократительной функции сердечной мышцы (Protsenko et al., Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol., 2005; Markhasin et al., Prog. Biophys. Mol. Biol., 2012; Balakin et al., Prog. Biophys. Mol. Biol., 2018).

Схематическое представление аппаратуры, используемой для исследования параллельных и последовательных гибридных дуплетов

Рис. 9. Слева: Схематическое представление аппаратуры, используемой для исследования параллельных и последовательных гибридных дуплетов. Справа: Экспериментальные записи развития силы и последовательного (А и В) и (С и D) гибридного дуплекса.

На изолированных трабекулах и папиллярных мышцах желудочка сердца теплокровных животных исследуется феномен среднесрочной регуляции сократительной активности миокарда – медленный ответ силы сокращения на резкое изменение длины мышцы. Мы показали, что этот весьма выраженный в здоровом миокарде феномен практически полностью подавлен в миокарде крыс с монокроталиновой моделью легочно-сердечной недостаточности (Lookin & Protsenko, Eur. Heart J., 2018; Lookin & Protsenko, J. Physiol. Sci., 2019).

Рис. 10. Эффект медленного прироста силы сокращения сердечной мышцы в ответ на внезапное ее растяжение (а) и выраженность этого эффекта в здоровом и патологически-измененном миокарде крысы (б).

С помощью одновременного измерения механической активности и кальциевой кинетики в изолированных кардиомиоцитах и многоклеточных препаратов миокарда установлены новые взаимоотношения между степенью нагружения миоцита и его сократительным ответом, а также роли кальциевой активации миофиламентов в механизмах Франка-Старлинга и среднесрочной регуляции сократимости (Lookin, Clin. Exp. Pharmacol. Physiol., 2020; Lookin et al., Prog. Biophys. Mol. Biol., 2021).

Рис. 11. Схема экспериментальной установки для одновременного измерения механических характеристик (силы сокращения и длины) и кальциевой кинетики (кальциевого перехода) в изолированной сердечной мышце. С помощью этой установки изучено влияние предрастяжения мышцы (преднагрузки) на характеристики спада кальциевого перехода и описан и изучен феномен «bump» - кратковременное замедление фазы спада кальциевого перехода (справа).

В лаборатории реализована методика карбоновых волокон (в конфигурации двух волокон) для механической фиксации изолированного кардиомиоцита при исследовании кальциевой регуляции его сократительной активности (Lookin & Protsenko, Front. Physiol., 2019). Феноменология электро-кальций-механического сопряжения и механо-электрических обратных связей в нормальном/патологическом миокарде исследуется с применением методов прецизионного измерения силы сокращения и задания деформации кардиомиоцита или сердечной мышцы, в сочетании с оптическими методами измерения кальциевой активности с использованием эпифлюоресцентной и лазерной сканирующей конфокальной микроскопии.

Рис. 12. Методики механической фиксации и растяжения изолированного кардиомиоцита с помощью карбоновых волокон и флюоресцентного окрашивания миоцита для измерения мембранного потенциала (потенциала действия) и кальциевых переходов.

Разработана и верифицирована уникальная математическая модель вязко-упругих свойств и геометрических размеров морфо-функционального элемента ткани миокарда – фасцикулы (пластины), которая защищена двумя кандидатскими диссертациями (Smoluk A et al 2017).

Рис. 13.  Графическое представление 3D модели и результаты верификации петель вязко-упругого гистерезиса папиллярной мышцы правого желудочка крысы

Проведена серия работ по исследованию кардиотоксического действия солей и наночастиц тяжелых металлов (свинца и кадмия). Установлены определенные различия в степени и направлении модификации сократительной активности препаратов папиллярных мышц и трабекул при хроническом воздействии этими металлами (Protsenko et al., Food Chem. Toxicol., 2018, 2019, 2020; Protsenko et al., Tox. Rep., 2020; Klinova et al. Int. J. Mol. Sci., 2021).

Разработаны программные средства для управления в реальном масштабе времени режимами сокращения изолированных сердечных мышц в физиологическом эксперименте. Это позволяет нам имитировать изометрический, изотонический, физиологический режимы сокращения сердечной мышцы (Protsenko et al., Food Chem. Toxicol., 2020).

Рис. 14. Диаграмма, поясняющая физиологический режим сокращения сердечной мышцы и пример построения петли «длина-сила», которая является аналогом петли «давление-объем» для целого сердца.

Также разработан программный комплекс для сохранения различных типов экспериментальных данных с последующей их обработкой, анализом и документированием (EqapAll6/EqapPackage6, разработка Лукина О.Н.).

•  
• 2021-2023 Грант РНФ 21-15-00169 «Ремоделирование структуры и функции правого предсердия и желудочка при легочно-сердечной недостаточности», рук. Ю.Л. Проценко;
• 2021-2022 Грант РФФИ-НЦНИ А 21-54-15001 «Внутриклеточная неоднородность электромеханического сопряжения в миокарде», рук. О.Н.Лукин;
• 2020-2022 Грант РФФИ 20-04-00130 А «Исследование влияния мутаций в гене TPM1, ассоциированных с врожденными заболеваниями сердца, на структурные и функциональные характеристики альфа- и каппа-изоформ тропомиозина», рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2020-2022 Грант РФФИ-Урал 20-44-660003 «Влияние нового миозин-модулирующего инотропного препарата CK-1827452 на механизмы гетерометрической и хронотропной регуляции сократимости миокарда в норме и при легочно-сердечной недостаточности», рук. Ю.Л. Проценко;
• 2018-2020 Грант РФФИ 18-04-00599 А «Теоретическое и экспериментальное исследование актин-миозинового взаимодействия в медленной скелетной мышце», рук. Н.А. Кубасова;
• 2018-2020 Грант РФФИ 18-34-20085 мол_а_вед «Исследование роли изоформ миофибриллярных белков в регуляции актин-миозинового взаимодействия в миокарде», рук. Д.В. Щепкин;
• 2018-2020 Грант РФФИ 18-015-00252 А «Роль модуляции функции изоформ сердечного миозина в механизме кальциевой регуляции актин-миозинового взаимодействия в норме и при патологии», рук. Г.В. Копылова;
• 2018-2020 Грант РФФИ 18-04-00572 А «Инактивирующий эффект систолического укорочения и метод его оценки при определении сократительного потенциала миокарда» в нормальном и гипертрофированном миокарде крысы», рук. О.Н. Лукин;
• 2017-2019 Грант РФФИ 17-00-00070 КОМФИ «Экспериментальное исследование влияния фосфорилирования тропомиозина, несущего кардиомиопатические мутации, на функциональные характеристики актин-миозинового взаимодействия в миокарде», рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2016-2018 Грант РФФИ 16-04-00688 А «Исследование влияния гомо- и гетеродимеров альфа- и бета-цепей тропомиозина на взаимодействие сократительных белков мышцы и свойства тонкой нити», рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2016-2018 Грант РНФ 16-14-10044 «Функциональная роль посттрансляционных модификаций белков сократительного аппарата поперечно-полосатых мышц», рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2016-2018 Грант РФФИ 16-04-00545 А «Оценка эффективности контура среднесрочной регуляции сократимости – «медленного ответа» в нормальном и гипертрофированном миокарде крысы», рук. Ю.Л. Проценко;
• 2015-2017 Грант РФФИ 15-34-20136 мол_а_вед «Структурно-функциональные исследования препаратов тропомиозина, несущих кардиомиопатические мутации в зоне контакта тропомиозина с тропонином», рук. Д.В. Щепкин;
• 2015-2017 Грант РФФИ 15-04-01558 А «Роль белков саркомера кардиомиоцитов в сократимости предсердий в норме и при патологии», рук. Г.В. Копылова;
• 2015-2017 Программа УрО РАН «Механизмы интеграции молекулярных систем при реализации физиологических функций», проект 15-5-4-6 «Кинетика кальций-тропониновых комплексов в кардиомиоцитах из разных отделов сердца крысы», рук. О.Н. Лукин;
• 2014-2016 Грант РФФИ 14-04-00085 А «Длинозависимая регуляция кинетики свободного внутриклеточного кальция при расслаблении миокарда желудочков», рук. О.Н. Лукин;
• 2014-2016 Грант РНФ 14-35-00005/2014 «Персонифицированные математические модели в кардиологии», рук. О.Э. Соловьева;
• 2013 Грант “OPTEC” LLC (exclusive Distributing Partner of the Carl Zeiss AG in Russia) «Study of the modulatory effect of cardiac myosin binding protein-C on the regulation of interaction of cardiac myosin isoforms with thin filament in an in vitro motility assay», рук. Д.В.Щепкин
• 2013-2015 Грант РФФИ 13-04-40101 КОМФИ «Исследование механических характеристик взаимодействия сократительных и регуляторных белков мышцы», рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2013-2015 Грант РФФИ-Урал 13-04-96027 «Функциональная значимость изоформ сократительных и регуляторных белков миокарда в норме и при патологии», рук. Л.В. Никитина;
• 2013-2015 Грант РФФИ 13-04-00367 А «Гендерные особенности систем регуляции сократимости миокарда при легочно-сердечной недостаточности», рук. Ю.Л. Проценко;
• 2012-2014 Грант РФФИ 12-04-31328-мол-а вед «Изучение роли конформационной нестабильности центральной части молекулы тропомиозина в регуляции актин-миозинового взаимодействия», рук. Д.В. Щепкин;
• 2012-2014 Интеграционный проект Президиума Уро РАН 12-С-4-1029 «Динамика сократительной функции миокарда крыс линии НИСАГ в ходе развития стресс-зависимой артериальной гипертензии», рук. В.С. Мархасин;
• 2012-2014 Программа Президиума РАН «Механизмы интеграции молекулярных систем при реализации физиологических функций», проект 12-П-4-1067 «Молекулярные механизмы регуляции кинетики внутриклеточного кальция в клетках водителей ритма и рабочего миокарда в норме и при патологии», рук. В.С. Мархасин;
• 2012-2014 Программа Президиума РАН «Механизмы интеграции молекулярных систем при реализации физиологических функций», проект 12-П-4-1059: «Молекулярные механизмы интеграции углеводного обмена в норме и при патологии (на примере сахарного диабета)», рук. И.Г. Данилова;
• 2011-2013 Грант РФФИ 11-04-00750 А «Исследование механизма остаточного напряжения в сокращающейся мышце», рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2011-2013 Программа Президиума РАН, проект «Исследование структурно-кинетических и энергетических характеристик миозинового мотора», рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2010-2012 Грант РФФИ-Урал 10-04-96065 «Изучение вклада сердечного миозин связывающего белка С в механическую функцию миокарда и ее регуляцию», рук. Л.В. Никитина;
• 2010-2012 Грант РФФИ 10-04-00601 А «Взаимодействие неоднородных сегментов миокарда в гипертрофированном сердце», рук. Ю.Л. Проценко;
• 2008-2010 Грант РФФИ 08-04-01085 А «Исследование механических и биохимических стадий цикла актин-миозинового мотора мышцы при физиологической температуре», рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2008-2010 Грант Президиума РАН «Исследование механических характеристик белковых моторов и разработка методов их использования в биомедицинских нанотехнологиях», рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2008-2010 Грант РФФИ 08-04-01137 А «Роль механических факторов в нарушении электромеханической функции сердечной мышцы при перегрузке кардиомиоцитов кальцием», рук. В.С. Мархасин;
• 2006 Грант РФФИ 06-04-58124 Организация и проведение международного семинара молодых учёных "Поперечно-полосатые мышцы: структура, функция, регуляция", рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2005-2007 Грант РФФИ 05-04-48359 А «Исследование взаимоотношений между молекулярной структурой и механической функцией в мышце», рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2005-2007 Грант РФФИ 05-04-48352 А «Электромеханическое и механоэлектрическое сопряжение в неоднородном миокарде», рук. В.С. Мархасин;
• 2005-2007 Грант РФФИ 05-04-48353 «Зависимость сократительной функции миокарда и ее регуляции от внутриклеточного содержания сердечных изомиозинов V1 и V3. Экспериментальное и теоретическое исследование.», рук. Л.В. Никитина;
• 2005-2007 Гранты поддержки Президента Российской Федерации «Ведущие научные школы», НШ-4923.2006.4 «Молекулярно-клеточные механизмы взаимодействия неоднородных сократительных элементов миокарда», рук. В.С. Мархасин;
• 2004-2008 Грант Wellcome Trust 074152/Z04/Z «Sub-cellular mechanisms underlying physiological and pathological effects of myocardial mechanical inhomogeneity», рук. Peter Kohl / В.С. Мархасин;
• 2004-2008 Грант NIH Fogarty International Center (GAP CRDF) 1 RO3 TW006250-01a1RFBR «Mechanoelectrical transduction in the myocardium», рук. Frederick Sachs / В.С. Мархасин;
• 2001-2003 Грант РФФИ 01-04-48158 А «Исследование структурных и механических событий в поперечных мостиках при мышечном сокращении», рук. С.Ю. Бершицкий;
• 2001-2005 Грант Медицинского Института Ховарда Хьюза С.Ю. Бершицкому – Howard Hughes Medical Institute (HHMI) International Research Scholarship;
• 1995-2000 Грант Медицинского Института Ховарда Хьюза С.Ю. Бершицкому – Howard Hughes Medical Institute (HHMI) International Research Scholarship.